冷熱沖擊試驗箱兩箱式和三箱式的區別如下：

結構不同：兩箱冷熱沖擊試驗箱分為高低溫箱和試樣箱兩部分分開，可以同時進行低溫試驗、高溫試驗和冷熱沖擊試驗。由于高低溫箱與試樣箱分離，所以該試驗箱的穩定性和可靠性相對較高，操作也更為方便。三箱冷熱沖擊試驗箱則是將高溫箱、低溫箱和試樣箱三部分分別設計在不同的箱體內。該試驗箱操作性能穩定，以及溫度控制方法更為先進，常常被用于高水平的電子產品和材料的冷熱沖擊性能的測試中。

溫度變化不同：兩箱式沖擊試驗箱試驗要比三箱式的沖擊試驗箱試驗要更劇烈一些，更能檢測產品的性能和產品的質量。三箱式沖擊試驗箱相比較兩箱式沖擊試驗箱環境溫度的變化更具適應性。兩款試驗箱的主要差異在于溫度的調控系統，三箱式冷熱沖擊試驗箱調控的更為精準。

綜上所述，冷熱沖擊試驗箱兩箱式和三箱式在結構、溫度變化等方面存在明顯的區別。用戶可以根據需要選擇適合自己的冷熱沖擊試驗箱。